Gerade nochmal nachgeschaut. Der Alpha-Channel funktioniert bei allen bearbeiteten gegebenen NPC's. Einfach die ".dds"- und ".msm"-Dateien mit den Alten ersetzen.
Es kann sein, dass sich bestimmte NPC's in unterschiedlichen ".epk"-Dateien befinden. Diese musst du dann dementsprechend bei dir im Client suchen und dort ersetzen.
Ich hatte einfach die kompletten Ordner kopiert. Hatte aber auch keine Wirkung. Und bei mir sind die NPC's nur im npc ordner so wie du sie auch hochgeladen hast.